Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP140Q13342 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SP140Q13342 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SP140Q13342 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP140Q13342 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP140Q13342 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP140Q13342 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP140Q13342 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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