Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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