Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms