Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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