Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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