Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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