Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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STRN3Q13033 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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