Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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