Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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