Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms