Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms