Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms