Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms