Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms