Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK16Q00536 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms