Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms