Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms