Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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