Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms