Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX1P83916 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX1P83916 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX1P83916 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms