Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms