Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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