Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC01547P58512 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms