Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms