Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RORCP51449 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORCP51449 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORCP51449 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORCP51449 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms