Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms