Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRXP46100 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms