Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCAMP43121 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms