Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBP1P32455 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBP1P32455 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBP1P32455 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms