Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms