Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PPIFP30405 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms