Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms