Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRHP20396 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRHP20396 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRHP20396 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms