Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms