Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms