Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RALAP11233 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RALAP11233 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms