Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3P10147 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms