Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms