Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms