Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB1P08034 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB1P08034 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms