Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms