Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERPIND1P05546 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms