Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms