Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms