Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2LO15068 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2LO15068 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms