Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms