Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DXG7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DXG7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DXG7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DXG7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DXG7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DXG7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms