Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A8MVJ9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.4 ms