Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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