Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TARSL2A2RTX5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms